En los últimos dos decenios se ha acumulado evidencia de amplias variaciones en la práctica de la medicina, por lo que, para desarrollar la Atención a la Salud Basada en Evidencias se requiere de un plan estratégico, basado en la práctica clínica reflexiva, lectura crítica de la literatura en salud y desarrollo de aptitudes para recuperar, analizar y aplicar la mejor información disponible, en forma oportuna, válida y científica con el propósito de contribuir a incrementar la calidad  y seguridad en los servicios de salud, con las estrategias sanitarias más efectivas y de acuerdo con los recursos disponibles.

Bajo esas consideraciones, para apoyar al personal de salud a nivel nacional, en su práctica cotidiana ante los pacientes, con el propósito de reducir el uso de intervenciones innecesarias o inefectivas y para facilitar el tratamiento de pacientes con el máximo beneficio, el mínimo riesgo y a un costo aceptable, se ha definido el Programa de Acción para el Desarrollo de Guías de Práctica Clínica.

Las Guías de Práctica Clínica proveen una descrip­ción de las posibles opciones de cuidados a la salud, incluyendo la racionalidad de cada una de ellas, redu­cen la injustificada variación en la atención médica, son un referente para la planeación de los recursos, constituyen un vehículo para la implantación de los conocimientos proporcionados por la investigación, establecen un medio de comunicación y de toma de decisiones entre los profesionales de la salud y los pacientes, sirven como criterios de calidad para la evaluación y monitoreo de la práctica clínica y, finalmente, constituyen un instrumento para hacer operativas las políticas públicas en salud cuyo objetivo fundamental es lograr el acceso universal a servicios de salud efectivos y seguros, centrados en la persona, la familia y la comunidad.

La estrategia sectorial ha sido aprobada por el Comité Nacional de Guías de Práctica Clínica , donde se considera la integración de guías por parte de las instituciones públicas del Sistema Nacional de Salud, la validación externa así como la autorización para su incorporación en el Catálogo Maestro de Guías de Práctica Clínica y su posterior difusión e implantación en las unidades médicas del Sector  Salud; estas dos últimas tareas, a cargo de la Dirección General de Calidad y Educación en Salud.

El propósito de la integración de Guías de Práctica Clínica (GPC), es poner al alcance del personal de salud información basada en la mejor evidencia disponible, sobre la efectividad de estrategias e intervenciones para contribuir en la mejora de la calidad y seguridad de la atención médica.

Las guías desarrolladas se han elaborado utilizando una metodología que cuenta con anexos  y un modelo editorial uniforme y consensuado sectorialmente. En lo general se realizan bajo la observancia teórica de la Medicina Basada en Evidencia mediante un procedimiento específico de revisión sistemática de la literatura.

En el período comprendido del 1ero de mayo 2008 al 31 de julio del  2009, se han integrado 178 GPC distribuidas de la siguiente manera: 60 en los Servicios de Salud de la Secretaria (SSA), 87 en el Instituto Mexicano del Seguro Social (IMSS), 22 en el Instituto de Seguridad y Servicios Sociales para los Trabajadores del Estado (ISSSTE; 8 integradas por SSA e IMSS y una integrada por ISSSTE e IMSS. De estas 178 guías, 9 han completado el proceso hasta la autorización por parte del Consejo de Salubridad General para su integración al Catálogo Maestro de Guías de Práctica Clínica,  16 están en trámites para su autorización y 156  se encuentran en proceso de revisión de la calidad de sus contenidos.